ذبیح‌الله مجاهد، سخنگوی طالبان، گزارش یک نهاد تحقیقاتی مستقر در ایالات متحده درباره ارتباط اعضای این گروه با شبکه القاعده را رد کرده و آن را «نادرست» خوانده است.
او این گزارش را «پروپاگند» دانسته و گفته است که چنین ادعاهایی با هدف «مغشوش‌ساختن ذهن عامه» مطرح می‌شود.
در مقابل، انستیتوت خاور میانه در گزارش تازه خود مدعی شده است که حدود ۵۵ تن از اعضا و مقام‌های طالبان دارای ارتباط مستقیم یا غیرمستقیم با القاعده هستند.
این گزارش که در قالب پروژه «ردیاب رهبری طالبان» تهیه شده، اطلاعات بیش از ۱۲۰۰ عضو این گروه را بررسی کرده و می‌گوید در بیش از ۲۰ درصد پروفایل‌ها، مواردی مانند ارتباط با گروه‌های مسلح یا فعالیت‌های خشونت‌آمیز ثبت شده است.
همچنین در این گزارش آمده است که تنها حدود ۵.۷ درصد از افراد شناسایی‌شده در فهرست تحریم‌های بین‌المللی قرار دارند، در حالی‌که بسیاری از اعضای ارشد طالبان شامل این تحریم‌ها می‌شوند.
در بخش دیگری از این بررسی، ساختار رهبری طالبان «متمرکز و عمدتاً نظامی» توصیف شده و گفته شده که بخش بزرگی از آن در اختیار یک قوم خاص و نیروهای با پیشینه نظامی است.
این در حالی است که مرکز بوش نیز در گزارشی جداگانه اعلام کرده که بیش از ۱۳۰ تن از رهبران طالبان تحت تحریم‌های بین‌المللی قرار دارند.
با وجود این ادعاها، طالبان این گزارش‌ها را رد کرده و آن‌ها را بخشی از جنگ رسانه‌ای علیه خود می‌داند.
